לשכת המגשרים הוקמה ופועלת למען קידום ענף הגישור ומעמד המגשר, כמו גם הקלת העומס בבתי המשפט לטובת האזרח הקטן וכל מי שרוצה לסיים את סכסוכיו ומחלוקותיו במהירות ובנינוחות. הלשכה פועלת כעמותה מבוקרת ללא כוונת רווח ומוביליה פועלים כמתנדבים ועל חשבון זמנם הפרטי.
לצורך כך, שמה לה הלשכה למטרה להילחם למען הענף ומעמד המגשר, לטפל במקצוענות המגשר ובנושאים אתיים העולים על הפרק.